Peptidová nukleová kyselina (PNA) je umělá molekula nukleové kyseliny, která má různé výhody oproti přirozené DNA a RNA, jako je vysoká selektivita, silná afinita a stabilita. Syntéza na pevné fázi je jednou z hlavních metod syntézy PNA s následujícími konkrétními kroky:
Výběr vhodných chránících skupin: Reakce chránících skupin s aminoskupinami nebo karboxylovými skupinami na prekurzoru PNA za vzniku esterů nebo amidů chránících skupin.
Připojení k polymerní pryskyřici: Prekurzor PNA modifikovaný ochrannou skupinou je připojen k polymerní pryskyřici, typicky pomocí polymerní pryskyřice s délkou uhlíkového řetězce 20-30 aminokyselinových zbytků.
Opakování cyklu syntézy: včetně odstranění N-koncové chránící skupiny; Přidejte další aminokyselinovou jednotku; Znovu proveďte ochranu N-svorek.
Deprotekce a separace: Po syntéze se peptidový řetězec PNA oddělí od polymerní pryskyřice alkalickým zpracováním nebo kyselou hydrolýzou a všechny ochranné skupiny se odstraní, aby se získal produkt PNA.
Tato metoda může účinně syntetizovat molekuly PNA až do délky několika set nukleotidů a syntetizované produkty mají vysokou čistotu, díky čemuž jsou vhodné pro výrobu ve velkém měřítku.
V praktických aplikacích však čistota PNA agregovaná obecnými automatickými syntetizéry není ideální. Výzkumný ústav HiPep vyvinul novou syntetickou metodu, která může poskytnout vysoce čisté produkty PNA. Tato metoda řeší některé problémy tradiční syntézy, jako jsou drahé ceny komponent, snadné sterické bránění ochranných skupin a významný dopad čistoty monomeru na biologickou aktivitu cílové PNA. Standardní rozsah syntézy je 10-15 bází a pro syntézu více než 16 základen, jedná se o speciální objednávku, která vyžaduje samostatný kontakt s dodavatelem
Kromě toho syntéza PNA také zahrnuje různé modifikační metody, jako je fluorescenční modifikace, modifikace biotinu, modifikace peptidů, glykosylace a modifikace DNA, aby byly splněny různé výzkumné potřeby. Proto je velmi důležité zvolit vhodné metody a techniky syntézy založené na konkrétní aplikaci. scénáře a požadavky.
